ABINIT-6.0.4

Dari PaloDozen

Daftar isi

Deskripsi

ABINIT merupakan perangkat lunak yang digunakan untuk menghitung struktur elektronik dari material dengan menggunakan density functional theory (DFT) dan diskritisasi gelombang bidang.

Lisensi

ABINIT didistribusikan dengan lisensi GPL v3.

Mengunduh

ABINIT dapat diperoleh di http://www.abinit.org/

Kompilasi dan Instalasi

Pada tahap konfigurasi, pilihan-pilihan berikut ini digunakan:

configure --prefix=/home/efefer/mysoftwares/abinit-6.0.4 
--with-mpi-prefix=/opt/openmpi --disable-netcdf

Setelah itu proses kompilasi dan instalasi dilakukan dengan perintah:

make
make install

Pemakaian

Untuk menjalankan ABINIT secara paralel dapat digunakan contoh script berikut:

#!/bin/sh
#
#$ -cwd
#$ -j y
#$ -S /bin/bash

export LD_LIBRARY_PATH="/home/efefer/mysoftwares/lib:$LD_LIBRARY_PATH"
/opt/openmpi/bin/mpirun -np 8 --nolocal --hostfile cluster.hosts -mca btl_tcp_if_exclude lo,eth1 $HOME/mysoftwares/abinit-6.0.4/bin/abinit < TiO2.files > log

Opsi berikut ini diperlukan untuk Dozen2010:

-mca btl_tcp_if_exclude lo,eth1

Pada Dozen2009 opsi ini tidak perlu digunakan ketika memanggil mpirun.

Rujukan


Kontributor: Fadjar, Mursito